テーマカスタマイザーでナビゲーションを設定するには、先にナビゲーション用のメニューを作成する必要があります。

ナビゲーション用メニュー作成

管理画面で下図のように、「メニュー」を選択します。

 
ナビゲーション用のメニューは、必ず「header-navigation」のメニュー名で作成してください。
 

※「header-navigation」以外のメニュー名では、ヘッダーナビゲーションとして設定されません。

メニュー項目の入力・設定

下図のように、メニュー項目を設定していきます。

メニューの入力・設定が終了したら、「ヘッダーナビゲーション」にチェックして、保存してください。
ヘッダーナビゲーション以外のカスタムメニューには、チェックの必要はありません。

なお、テーマカスタマイザーでも表示を確認してください。