ナビゲーションをキレイに並べるため、ナビゲーションのカラム数の設定が必要です。
作成されるサイトで、ヘッダーナビゲーションに設定する項目の数と同一に設定してください。また、カラム数が多くなり文字がはみ出す等で文字サイズ調整が必要になる場合は、文字の大きさを変更して下さい。

 
ナビゲーション個数の設定が必要なのは、「SP1710」「SP1720」テーマです。
ナビゲーションの個数と設定個数が一致していない場合、サイト表示が壊れる、段落ちするなどの障害が起きます。
他は、文字サイズのみの設定、「SP1740」のように設定が無いテーマもあります。